В розыгрыше Кубка России-2006/2007 принимало участие 119 команд. Турнир стартовал со стадии 1/512 финала, при этом начиная с 1/16 победитель определялся по итогам двух матчей. Именно на этой стадии в борьбу вступил «Локомотив».

Соперником красно-зелёных стал махачкалинский «Анжи». В первой игре «Локо» победил — 4:2, вторая закончилась вничью — 1:1. Из 1/16 финала «железнодорожники» шагнули сразу в четвертьфинал, так как махачкалинское «Динамо» не сумело пройти аттестацию.

Затем «Локомотиву» пришлось биться исключительно в дерби. Сначала на пути «железнодорожников» встало «Динамо». Победив в первом матче со счётом 1:0, бело-голубые капитулировали в ответном — 0:4. В полуфинале соперником «Локомотива» был «Спартак». Исход противостояния предопределил разгром в первой игре — 3:0. Но и вторую «железнодорожники» также выиграли, но уже с более скромным счётом, 2:1.

В финале «Локо» встретился с ФК «Москва» на синтетическом поле «Лужников» при 30-градусной жаре. Команды доиграли до дополнительного времени, где всё решил рывок Дмитрия Сычёва по флангу и победный гол Гарри О’Коннора.

«Сыч сделал великолепный проход! У него потрясающая скорость, и когда он обошёл защитника, мне удалось поймать его взгляд. И я понял: он хочет отдать мне пас! После чего отскочил от защитника и замкнул передачу партнёра. Забить победный мяч в кубковом финале — мечта любого нападающего. И мне это удалось!» — делился эмоциями шотландец.
«Правильнее было отдать пас, чем пробить, потому что Жевнов занимал верную позицию в воротах», — рассказывал Сычёв.

Главным тренером того «Локомотива» был Анатолий Бышовец, а президентом клуба — Юрий Сёмин.

Кубок России-2006/2007. Финал

«Локомотив» — «Москва» — 1:0 (0:0, 0:0, в дополнительное время — 1:0)
Гол: О’Коннор, 102.

«Локомотив»: Якупович, Иванович, Родолфо, Ефимов, Спахич, Гуренко, Концедалов (О'Коннор, 63), Билялетдинов, Самедов (Фининью, 110), Лоськов, Сычёв.
«Москва»: Жевнов, Годунок, Баррьентос, Кузьмин, Ребежа (Голубов, 106), Быстров, Набабкин, Йоп, Семак (Иванов, 46), Бракамонте (Чижек, 76), Адамов.

Предупреждения: Баррьентос, Йоп, Ефимов, Лоськов.

Судья: Юрий Баскаков (Москва).

27 мая 2007 года. Москва, стадион «Лужники».

Пресс-служба ФК «Локомотив»